More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0621 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  90.71 
 
 		 269 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  70 
 
 		 269 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  50.94 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  51.15 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  51.74 
 
 		 262 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  51.74 
 
 		 262 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  52.12 
 
 		 262 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  51.92 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  47.58 
 
 		 270 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  37.21 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 206 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  35.64 
 
 		 209 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  36.31 
 
 		 223 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  34.81 
 
 		 205 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.31 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  36.45 
 
 		 209 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.31 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.31 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.31 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34.81 
 
 		 205 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  35.91 
 
 		 207 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  38.8 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  35.96 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  35.2 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  38.07 
 
 		 216 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  36.5 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  37.08 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  37.5 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  35.52 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  33.9 
 
 		 208 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  37.1 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  35.88 
 
 		 200 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  35.91 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  35.88 
 
 		 200 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  36.81 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  37.07 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  36.45 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  32.77 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  32.77 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  35.6 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  35.6 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  35.6 
 
 		 215 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  35.6 
 
 		 206 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 208 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  35.6 
 
 		 206 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  35.6 
 
 		 206 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 219 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 208 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 208 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 227 aa  99  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  32.31 
 
 		 206 aa  99  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.96 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 207 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  34.69 
 
 		 222 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  35.6 
 
 		 545 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  33.89 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  32.76 
 
 		 208 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  36.95 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  33.51 
 
 		 220 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34.68 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  36.13 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  36 
 
 		 217 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  32.96 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  38.15 
 
 		 219 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  33.7 
 
 		 206 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 206 aa  96.3  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  37.71 
 
 		 219 aa  95.9  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  35.2 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  35.2 
 
 		 217 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  31.21 
 
 		 202 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  34.55 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 204 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  34.66 
 
 		 208 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  34.76 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 217 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 199 aa  92.4  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  30.54 
 
 		 237 aa  92.4  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  34.95 
 
 		 223 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  33.15 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  32.98 
 
 		 205 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  33.7 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  33.92 
 
 		 205 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.58 
 
 		 210 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  30.51 
 
 		 200 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>