More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1469 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  100 
 
 		 226 aa  460  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  33.51 
 
 		 318 aa  118  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  37.08 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.4 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  35.36 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  34.64 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  34.24 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.4 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  31.15 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.83 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  32.76 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  34.27 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  35.36 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.3 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.27 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  34.27 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  35.36 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  31.72 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.86 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  30.05 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  31.02 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  32.64 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  31.84 
 
 		 205 aa  95.9  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  30.48 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  32.65 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  33.17 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  30.13 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.11 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  32.78 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  30.62 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  32.78 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  31.98 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  31.35 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  31.16 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  30.53 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  42.98 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  34.29 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  32.16 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  30.69 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  30 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  34.1 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  30.9 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  33.14 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  27.22 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  35.64 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  34.46 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  31.58 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  31.58 
 
 		 201 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  31.21 
 
 		 221 aa  84.7  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  35.29 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  31.18 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  29.65 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  32.4 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  30.85 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  32.4 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  35.5 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  29.44 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  28.46 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  27.19 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  30.21 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  28.65 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  30.05 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  30.73 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  32.57 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  34.46 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  30.58 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  29.69 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  28.42 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  30.65 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  29.69 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  28.42 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  29.69 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>