269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2099 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  100 
 
 		 127 aa  263  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  82.68 
 
 		 127 aa  206  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  84.25 
 
 		 127 aa  206  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  75.51 
 
 		 119 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  70.48 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  70.48 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  75.76 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  69.52 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  69.52 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  69.52 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  69.52 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  74.75 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  69.52 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  73.74 
 
 		 119 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  73.74 
 
 		 119 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  73.74 
 
 		 119 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  73.74 
 
 		 119 aa  151  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  55.1 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1000  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  52.17 
 
 		 133 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0988  cytochrome c, class I  55.34 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0866  putative periplasmic cytochrome type-C oxidoreductase signal peptide protein  49.6 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.525765  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1025  cytochrome c, class I  54.37 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0931  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  52.34 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.678097  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  48.62 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  48.45 
 
 		 220 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  46.99 
 
 		 224 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  48.72 
 
 		 221 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  55.13 
 
 		 219 aa  87.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  44.58 
 
 		 219 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  44.58 
 
 		 219 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  44.19 
 
 		 221 aa  83.6  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  48.19 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  43.21 
 
 		 225 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 221 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  44.55 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  48.31 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  41.9 
 
 		 207 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  41.44 
 
 		 211 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  42.22 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  47.3 
 
 		 209 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  43.62 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  41.57 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  46.15 
 
 		 318 aa  63.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  34.51 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  36.84 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  40.54 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  42.31 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  39 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  47.22 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  41.94 
 
 		 269 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  39.6 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  41.75 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  40.51 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  34.23 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  36.54 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  35.64 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  34.58 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  38.68 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  31.9 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  37.72 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  40.51 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  42.39 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  37.66 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  34.78 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  34.91 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  38.55 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  34.21 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  43.59 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  36.19 
 
 		 265 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  43.59 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  36 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  37.76 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  34.74 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  36.63 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  39.77 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  36.36 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  36.47 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>