More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3050 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  100 
 
 		 106 aa  219  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  61 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  62.65 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  62.5 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  56.18 
 
 		 206 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  57.5 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  46.73 
 
 		 220 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  48.51 
 
 		 221 aa  97.1  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  51.25 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  51.85 
 
 		 224 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  43.43 
 
 		 221 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  44.79 
 
 		 225 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  50.6 
 
 		 221 aa  92.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  49.04 
 
 		 219 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  49.41 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 219 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  46.88 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0999  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  53.01 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.209116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0987  cytochrome c, class I  49.4 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  53.85 
 
 		 219 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  54.88 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0907  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  43.14 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.153679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  51.85 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  51.85 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  51.85 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  51.85 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1171  cytochrome c family protein  51.85 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  51.85 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  49.51 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2354  cytochrome c class I  51.22 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2370  cytochrome c, class I  52.44 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2250  cytochrome c class I  52.44 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0946  cytochrome c class I  51.22 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5673  cytochrome c, class I  51.22 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2331  cytochrome c, class I  51.22 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1719  cytochrome c, class I  51.22 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  53.25 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  45.92 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0865  cytochrome c class I  45.78 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394911  normal  0.438525 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0930  cytochrome c class I  45.78 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0935  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  51.76 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  47.19 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  42.31 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  41.51 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  47.95 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  42.39 
 
 		 206 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  42.53 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1232  cytochrome c class I  43.88 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.730475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  40.21 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3314  putative cytochrome C precursor-related protein  50.7 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717977  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  38.68 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  45.78 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  44.21 
 
 		 207 aa  66.6  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  47.78 
 
 		 196 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  40 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  46.99 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  37.96 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  40 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  40 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  40.19 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  37.86 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  37.86 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  39.76 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  41.75 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  39.76 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  43.82 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  40.43 
 
 		 318 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  37.27 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  37.27 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  42.17 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  37.27 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  35.96 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  36.96 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  42.27 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  41.11 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  37.8 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  39.73 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  46.05 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  39.56 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  39.58 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  41.98 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  45.07 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  32.35 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>