254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0935 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0935  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  100 
 
 		 124 aa  254  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0907  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  79.34 
 
 		 121 aa  200  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.153679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0999  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  67.37 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.209116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0930  cytochrome c class I  56.56 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  56.78 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0865  cytochrome c class I  56.56 
 
 		 122 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394911  normal  0.438525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  63.16 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  65.88 
 
 		 221 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  53.91 
 
 		 220 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  54.39 
 
 		 219 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  54.39 
 
 		 219 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  59.09 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0987  cytochrome c, class I  59.14 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  61.36 
 
 		 221 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  56.6 
 
 		 221 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  50.83 
 
 		 222 aa  120  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  59 
 
 		 224 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1719  cytochrome c, class I  55.56 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2354  cytochrome c class I  55.56 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408751 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2331  cytochrome c, class I  55.56 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  58.62 
 
 		 225 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1232  cytochrome c class I  61.95 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.730475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5673  cytochrome c, class I  54.55 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2250  cytochrome c class I  54.55 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2370  cytochrome c, class I  54.55 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0946  cytochrome c class I  54.55 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  52.94 
 
 		 230 aa  113  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3314  putative cytochrome C precursor-related protein  63.16 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717977  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  53.85 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  53.85 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  53.85 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1171  cytochrome c family protein  53.85 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  53.85 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  53.85 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  54.44 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  55.56 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  56.79 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  51.76 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  46.15 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  44.87 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  38.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  42.16 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  38.14 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  37.17 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  39.58 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  37.17 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  34.29 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  38.38 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  37.37 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  31.9 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  37.97 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  34.23 
 
 		 195 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  43.37 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  34.95 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  38.3 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  35.56 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  31.93 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.05 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.05 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  33.98 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  37.78 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  32.2 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  32.2 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  39.29 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  32.2 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  32.2 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  32.2 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  33.61 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  31.36 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  45.1 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  28.46 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  39.18 
 
 		 219 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  32.22 
 
 		 206 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  38.96 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 227 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  36.62 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 201 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  34.51 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0006  monoheme cytochrome c  33.33 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  31.97 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0006  monoheme cytochrome c  33.33 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  37.11 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  31.75 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0006  monoheme cytochrome c  33.33 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30.25 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>