More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2741 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  98.99 
 
 		 198 aa  396  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  81.82 
 
 		 195 aa  337  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  60.82 
 
 		 191 aa  244  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  53.89 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  37.06 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  35.18 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  35.9 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.38 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.38 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.38 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.51 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.46 
 
 		 318 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  35.93 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 255 aa  104  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  36.92 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  31.46 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  32.58 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  32.66 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  34.46 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  32.34 
 
 		 219 aa  98.6  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  33.51 
 
 		 221 aa  97.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 226 aa  97.8  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  33.86 
 
 		 222 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  33.33 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  31.74 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  31.05 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 220 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  33.9 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  29.59 
 
 		 256 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 227 aa  95.1  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  32.64 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  30.93 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  31.93 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  34.95 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  30.2 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  32.46 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  31.41 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  32.46 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  29.8 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 265 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  29.95 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  29.11 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  30.81 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  31.41 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.05 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  32.37 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.24 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  30.05 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  31.74 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  35.41 
 
 		 221 aa  91.3  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  35.09 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  31.41 
 
 		 221 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  30.23 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  32.4 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  30.34 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  30.34 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  30.34 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  30.37 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  30.34 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  33.51 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  32.99 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  31.75 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  30.34 
 
 		 265 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  30.34 
 
 		 265 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  31.5 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  31.55 
 
 		 220 aa  88.6  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  30.34 
 
 		 545 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  34.43 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  35 
 
 		 218 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  30.77 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  29.35 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  33.16 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  29.21 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  32 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  30 
 
 		 222 aa  85.1  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  32.28 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  32.28 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  30.54 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  30.54 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  28.22 
 
 		 208 aa  84.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>