More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00326 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  100 
 
 		 91 aa  189  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  82.93 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  60.76 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  57.5 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  46.59 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  49.4 
 
 		 230 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  39.56 
 
 		 206 aa  88.2  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1719  cytochrome c, class I  48.35 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2331  cytochrome c, class I  48.35 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2354  cytochrome c class I  48.35 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0946  cytochrome c class I  47.25 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5673  cytochrome c, class I  47.25 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  46.15 
 
 		 220 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2250  cytochrome c class I  47.25 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  45.68 
 
 		 225 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2370  cytochrome c, class I  47.25 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  46.91 
 
 		 219 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  45.12 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  45.68 
 
 		 221 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  45.78 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  47.56 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  47.56 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1171  cytochrome c family protein  47.56 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  47.56 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  47.56 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  47.56 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0999  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  47.5 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.209116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0907  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  48.65 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.153679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  53.03 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  47.37 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  51.52 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 222 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0987  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  51.52 
 
 		 221 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  46.84 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  44.87 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0930  cytochrome c class I  44.87 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0865  cytochrome c class I  44.87 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394911  normal  0.438525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  46.75 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0935  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  46.15 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  45.98 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  37.78 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  38.37 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  36.67 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  40 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  44.93 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 206 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  32.93 
 
 		 195 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1232  cytochrome c class I  46.75 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.730475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  40 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  40 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3314  putative cytochrome C precursor-related protein  47.3 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717977  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  36.67 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  38.2 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  37.97 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  35.71 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  35.11 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  40.45 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  43.84 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  35.48 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  37.08 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  41.79 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  38.96 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  36.46 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  36.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  29.67 
 
 		 318 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 206 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 222 aa  57  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  34.44 
 
 		 222 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 209 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  34.72 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  32.58 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  39.19 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  40.7 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>