More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7221 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  100 
 
 		 112 aa  221  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  84.91 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  70.79 
 
 		 105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  62.34 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  50 
 
 		 191 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  50.56 
 
 		 318 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  50 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  48.39 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  51.58 
 
 		 202 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  42.31 
 
 		 198 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  42.31 
 
 		 198 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  43.43 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  43.43 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  48.84 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  43.16 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  47.67 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  47.44 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  39.45 
 
 		 193 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  46.39 
 
 		 209 aa  77  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  45.26 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  46.99 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  47.95 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  39.78 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  45.57 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  39.78 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  46.07 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  45.07 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  44.68 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  44.05 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  42.45 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  40.87 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  44.71 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  39.81 
 
 		 207 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  45.92 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 206 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  42.86 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  48.1 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  45.16 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  39.78 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  39.78 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  39.78 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  42.17 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  42.61 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  47.14 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  45.45 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  40.82 
 
 		 219 aa  70.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  42.27 
 
 		 205 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  46.15 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  39.6 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  41.58 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  45.21 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  45 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  41.3 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  40.96 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  37 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  49.3 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  48.78 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  40.78 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  43.96 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  38.53 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  39.39 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  45 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  38.46 
 
 		 206 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  41.46 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  46.25 
 
 		 878 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  50.82 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  37.21 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  42.72 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  44.83 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  41.57 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  41.25 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  52.44 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  37.76 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  44.16 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  42.55 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1176  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000869093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>