272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1233 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  94.49 
 
 		 127 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  84.25 
 
 		 127 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  73.47 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  73.74 
 
 		 119 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  62.99 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  62.99 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  72.73 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  72.73 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  72.73 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  72.73 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  62.2 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  62.2 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  62.2 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  62.2 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  62.2 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  71.72 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  59.43 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  51.82 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0866  putative periplasmic cytochrome type-C oxidoreductase signal peptide protein  53.85 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.525765  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0988  cytochrome c, class I  56.31 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1000  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  50 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1025  cytochrome c, class I  54.37 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0931  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  54.21 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.678097  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  46.39 
 
 		 220 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  50 
 
 		 221 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  46.75 
 
 		 224 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  52.56 
 
 		 219 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 221 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  44.16 
 
 		 219 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  44.16 
 
 		 219 aa  83.6  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  43.21 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  45.78 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  41.84 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  45.74 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  47.3 
 
 		 209 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  41.57 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  40.59 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  39.64 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  36.54 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  40.45 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  47.22 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  41.84 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  36.36 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  45.95 
 
 		 318 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  40.23 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  41.3 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  39.13 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  36.54 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  36.94 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  33.33 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  40.48 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  36.21 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  36.94 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  35.34 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  37.66 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  36.71 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  34.62 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 217 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  33.33 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  36.78 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  33.64 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  33.64 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  33 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  32.74 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  36.71 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  35.16 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  36.47 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  35.42 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  34.95 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  37.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  40.22 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  32.2 
 
 		 545 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>