More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3951 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  79.19 
 
 		 219 aa  354  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  78.73 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  69.06 
 
 		 221 aa  314  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  70.59 
 
 		 224 aa  312  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  64.44 
 
 		 225 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  65.18 
 
 		 222 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  65.47 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  57.52 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  56 
 
 		 230 aa  247  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  57.21 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  65.09 
 
 		 115 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0987  cytochrome c, class I  71.76 
 
 		 114 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0999  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  70.59 
 
 		 115 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.209116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0930  cytochrome c class I  58.93 
 
 		 122 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0865  cytochrome c class I  68.24 
 
 		 122 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394911  normal  0.438525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0907  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  57.69 
 
 		 121 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.153679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  56.86 
 
 		 126 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0935  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  60.91 
 
 		 124 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  35.62 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1232  cytochrome c class I  58 
 
 		 122 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.730475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2370  cytochrome c, class I  59.55 
 
 		 119 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2250  cytochrome c class I  59.55 
 
 		 119 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2331  cytochrome c, class I  59.55 
 
 		 119 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1719  cytochrome c, class I  59.55 
 
 		 119 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2354  cytochrome c class I  59.55 
 
 		 119 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  49.5 
 
 		 111 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  61.73 
 
 		 109 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  59.49 
 
 		 119 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  59.49 
 
 		 119 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1171  cytochrome c family protein  59.49 
 
 		 119 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  59.49 
 
 		 119 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  59.49 
 
 		 119 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5673  cytochrome c, class I  58.43 
 
 		 119 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  59.49 
 
 		 119 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  59.49 
 
 		 119 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0946  cytochrome c class I  57.3 
 
 		 119 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3314  putative cytochrome C precursor-related protein  64.38 
 
 		 122 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717977  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.48 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.48 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.95 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  34.38 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  32.13 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  34 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  33.49 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  30.28 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30.23 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.17 
 
 		 318 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  30.28 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  32.29 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  30.89 
 
 		 191 aa  94.7  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  32.47 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  45.1 
 
 		 106 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  34.5 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  34.5 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  29.03 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  32.39 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  34.5 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  33.16 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  31.48 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  32.24 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  31.96 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  34.39 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  31.02 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  32.98 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  28.84 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  31.02 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  31.02 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  31.41 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  33.53 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  28.97 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  32.45 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  30.73 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  32 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  28.97 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.22 
 
 		 265 aa  88.6  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1000  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  46.94 
 
 		 133 aa  88.6  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  29.77 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  31.4 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0866  putative periplasmic cytochrome type-C oxidoreductase signal peptide protein  47.96 
 
 		 132 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.525765  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0931  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  47.96 
 
 		 132 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.678097  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  30.52 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  34.78 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  30.92 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  34.78 
 
 		 265 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  34.78 
 
 		 265 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  34.78 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>