More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0288 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  100 
 
 		 107 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  62.34 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  61.04 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  58.44 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  43.88 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  50.63 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  46.58 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  54.93 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  45 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  52.63 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  45.21 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  43.84 
 
 		 198 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  57.81 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  41.03 
 
 		 191 aa  76.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  42.71 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  50.7 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  46.23 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  46.23 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  46.23 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  42.27 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  45.68 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  50.75 
 
 		 266 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  36.04 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  48.57 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  39.6 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  41.77 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  47.19 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  48.57 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  44.34 
 
 		 207 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  42.47 
 
 		 200 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  44.19 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  50 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  44.19 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  54.84 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  39.44 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  48.78 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  41.58 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  45.54 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  42.11 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  45.54 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  44.44 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  45.54 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  41.1 
 
 		 200 aa  70.5  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  47.19 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  45.63 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  39.58 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  41.25 
 
 		 222 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  41.25 
 
 		 222 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 270 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  42.22 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  47.69 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  41.51 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  47.3 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  40.91 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  47.14 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  46.43 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1176  cytochrome c class I  45.31 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000869093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  47.69 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  48.48 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  37.63 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  48.57 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  45.83 
 
 		 206 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  42.86 
 
 		 271 aa  67  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  44.93 
 
 		 205 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  41.89 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0006  monoheme cytochrome c  34.88 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  41.89 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  37.38 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  43.86 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  50.7 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0006  monoheme cytochrome c  34.88 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  39.45 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  50 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0714  monoheme cytochrome c  33.72 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  41.84 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  43.48 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0006  monoheme cytochrome c  34.88 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  46.91 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  41.98 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  47.83 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  44.44 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  40.7 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  39.74 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  49.28 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  47.95 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>