More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05467 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  100 
 
 		 129 aa  271  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  61.68 
 
 		 110 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  48.08 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  57.89 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  47.12 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  49.04 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  50 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  44.68 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  40.38 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  40.38 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  40.38 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  40.38 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  55.38 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  39.22 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  41.82 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  46.75 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 206 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  40.78 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  36.67 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  48.61 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  39.81 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  37.63 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  40 
 
 		 206 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  43.04 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  35.51 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  36.27 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  37.14 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  32.46 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  36.27 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  37.86 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  39.74 
 
 		 318 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.3 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.3 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.3 
 
 		 207 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  41.67 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  42.5 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  42.86 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  40 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  41.67 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  37.38 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  43.53 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  41.25 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  46.58 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  36 
 
 		 209 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  44.74 
 
 		 201 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  39.58 
 
 		 220 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 217 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0717  monoheme cytochrome c  39 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  39.19 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  46.91 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  47.76 
 
 		 226 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  29.57 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  35.53 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  33.05 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  34.51 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  33.06 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0009  cytochrome c class I  45.59 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0009  monoheme cytochrome c  45.59 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0009  monoheme cytochrome c  45.59 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  41.79 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  40.28 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  41.1 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  40 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  38.71 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  33.98 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  38.36 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  37.5 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  38.36 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>