More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1072 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1072  cytochrome c553  100 
 
 		 113 aa  239  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.538556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  38.61 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  34.91 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 211 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  38.89 
 
 		 195 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  34.86 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  37.84 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  41.43 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  31.78 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  41.43 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  30 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  39.44 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  36.94 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  37.23 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  34.86 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  40.58 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  38.89 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  33.93 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  29.09 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  33.33 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  38.78 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  36.14 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  40.54 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  39.29 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  32.41 
 
 		 265 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  30.63 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  36.23 
 
 		 237 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 215 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  33.33 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  36.62 
 
 		 238 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  36.62 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  33.66 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  36.62 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  36.62 
 
 		 238 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 236 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  32.48 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.53 
 
 		 318 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  31.53 
 
 		 207 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  31.48 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  32.71 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 236 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 266 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  32.41 
 
 		 215 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  32.41 
 
 		 265 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 203 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  32.41 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  36.23 
 
 		 257 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  32.41 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  36.23 
 
 		 240 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  32.41 
 
 		 265 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  32.41 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  30.58 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 236 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 207 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  50 
 
 		 226 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 209 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 207 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 207 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 207 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 229 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 207 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 229 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  37.36 
 
 		 252 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  39.66 
 
 		 228 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  32.41 
 
 		 545 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>