More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2081 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  59.79 
 
 		 191 aa  236  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  56.32 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  54.64 
 
 		 198 aa  214  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  54.12 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.73 
 
 		 318 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.8 
 
 		 265 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  33 
 
 		 256 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  35.03 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  35.03 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  35.03 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  35.03 
 
 		 265 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  35.03 
 
 		 265 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  35.03 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  33.95 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  35.12 
 
 		 221 aa  98.2  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  34.86 
 
 		 208 aa  97.8  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  31.5 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  35.03 
 
 		 545 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  31.78 
 
 		 219 aa  95.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 219 aa  94.4  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  32.57 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  34.44 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  33.51 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  35.08 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  32.82 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  31.28 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  32.82 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  34.92 
 
 		 224 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  34.1 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  35.1 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 208 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  30.29 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  30.29 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  30 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  30 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  35.67 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  30 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  30 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  32.39 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  34.44 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  30.35 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.53 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 217 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  35.67 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 242 aa  89.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  34.65 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  28.85 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  28.85 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  30.98 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  31.35 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  29 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 217 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  29.38 
 
 		 221 aa  87.8  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  32.4 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  29.58 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  29 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.12 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  29 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  32.31 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  29.83 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  33.83 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  31.33 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  33.83 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  32.24 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  33.49 
 
 		 224 aa  85.5  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  29.47 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  29.47 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  29.83 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 227 aa  85.1  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  28.42 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  34.97 
 
 		 292 aa  85.1  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  29.47 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  30.39 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  35.44 
 
 		 262 aa  84.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  32.78 
 
 		 217 aa  84.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  32.94 
 
 		 270 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  29.81 
 
 		 208 aa  84.3  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  29.74 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  29.74 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  31.15 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  28.42 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  30.88 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  35.06 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  30.53 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>