More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0123 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  100 
 
 		 418 aa  818    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  62.33 
 
 		 238 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.57 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.17 
 
 		 206 aa  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  32.57 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  31.43 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  31.05 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  34.63 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  28.51 
 
 		 223 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  30.95 
 
 		 205 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  30.14 
 
 		 205 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  31.72 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  31.65 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  51.19 
 
 		 112 aa  77.4  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  32 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  31.86 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  30.84 
 
 		 202 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.17 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  30.84 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  31.6 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  33.96 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  29.6 
 
 		 205 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 206 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.45 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  32.24 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  29.73 
 
 		 205 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 205 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  33.33 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3779  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.3 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1660  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0290388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.61 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1479  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  31.39 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  42.59 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  34.26 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  46.25 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4302  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.86 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0300725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  28.99 
 
 		 214 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  31.08 
 
 		 206 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  33.5 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1933  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.2 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0570892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  30.21 
 
 		 216 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1087  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.67 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  30.33 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  25.23 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  29.29 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1833  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.32 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  29.76 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 102 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  30.09 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.16 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  31.19 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1721  cytochrome c, class I  31.98 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0664  cytochrome c oxidase  32.88 
 
 		 287 aa  67  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  34.36 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  30.05 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  34.36 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  34.36 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  34.36 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  34.36 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  31.68 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.68 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  34.36 
 
 		 215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  29.36 
 
 		 224 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  30.23 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.68 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.23 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  34.36 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.3 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  31.44 
 
 		 218 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  30.05 
 
 		 198 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.68 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  30.28 
 
 		 219 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.68 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127298  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  30.28 
 
 		 219 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  25.55 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  30.2 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  33.98 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2607  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.51 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00078494  normal  0.780558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  27.68 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  27.44 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>