More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3651 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  100 
 
 
112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  63.64 
 
 
104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  59.6 
 
 
104 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  69.51 
 
 
107 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  54.81 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  65.12 
 
 
108 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  60.24 
 
 
105 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  60.24 
 
 
105 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  64.63 
 
 
98 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  60.24 
 
 
105 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  55.56 
 
 
103 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  57.69 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  56.52 
 
 
223 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  53.16 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  55.68 
 
 
205 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  55.68 
 
 
205 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  55 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  61.11 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  53.41 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  51.92 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  51.76 
 
 
198 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  42.99 
 
 
206 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  49.37 
 
 
110 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  42.99 
 
 
206 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  47.37 
 
 
205 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  45.65 
 
 
318 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  42.99 
 
 
206 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  55.56 
 
 
100 aa  84.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  42.99 
 
 
206 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  45.19 
 
 
193 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  41.59 
 
 
229 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  46.74 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  43.12 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  51.58 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  42.99 
 
 
207 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  38.18 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  52.56 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  42.06 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  42.59 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  41.12 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  41.12 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  49.4 
 
 
200 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  52.44 
 
 
200 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  41.12 
 
 
207 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  41.12 
 
 
207 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  41.12 
 
 
207 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  41.12 
 
 
207 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  41.12 
 
 
207 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  45.35 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  43.33 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  46.79 
 
 
206 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  39.25 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  48.19 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  45.24 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  42.27 
 
 
212 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  52.38 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  41.9 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  45.45 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  50.67 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  44.23 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  46.46 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  51.25 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  51.25 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  47.87 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  47.42 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  43 
 
 
221 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  45.63 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  46.15 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  41.12 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  47.42 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  49.38 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  45.35 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  50 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  42.86 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  47.57 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  40.57 
 
 
222 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  47.06 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  41.51 
 
 
221 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  44.66 
 
 
205 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  44.66 
 
 
205 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  40.95 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  52.44 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  44.19 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  43.33 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  45.12 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  43.33 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  48.65 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  48.61 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  34.71 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  38.89 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  45.35 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  37.5 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  40.51 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  37.61 
 
 
224 aa  67.8  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  40.51 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  47.95 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  49.41 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  42.72 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  44.64 
 
 
265 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  41.82 
 
 
209 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>