More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3262 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  100 
 
 		 108 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  62.16 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  53.85 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  43.3 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  39.05 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  52.87 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  50.65 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  55.84 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  44.44 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  47.73 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  44.21 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  51.39 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 213 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  44 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  44.32 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  37.62 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  30.56 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  48.68 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  41.54 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  43.66 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  38.67 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  42.67 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  37.65 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  32.71 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  40 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  36.54 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  43.06 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  36.54 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  40 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  33.02 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  36 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  42.25 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  42.25 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  43.08 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  42.25 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  39.13 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  39.71 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  42.25 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  42.25 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  42.86 
 
 		 545 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.39 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  29.52 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  37.68 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 265 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  34.41 
 
 		 281 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 236 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  32.69 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  35.29 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  32.69 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  29.52 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  35.94 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  46.15 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  36.54 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  37.68 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.14 
 
 		 318 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  40.28 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  40.54 
 
 		 208 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  35.53 
 
 		 194 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  37.5 
 
 		 239 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  36.49 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  35.29 
 
 		 237 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 230 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  34.21 
 
 		 200 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  35.21 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  35.29 
 
 		 230 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  40 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  34.88 
 
 		 240 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  34.21 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  42.86 
 
 		 253 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  32.67 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  33.96 
 
 		 198 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  31.08 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 205 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  33.96 
 
 		 198 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 217 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 267 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  32.61 
 
 		 257 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>