287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4438 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  100 
 
 		 112 aa  231  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  51.92 
 
 		 125 aa  106  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  59.21 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  54.67 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  54.67 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  54.05 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  48.31 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  46.84 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  45.45 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  42.59 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  48.61 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  41.86 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  30.36 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  39.73 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 212 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  41.1 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  44 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  36.47 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  39.51 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  44.93 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  47.89 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  35.29 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  42 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  36.36 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  40.28 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  37.66 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  36.23 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  36.23 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  38.64 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 318 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  40 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  38.64 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  41.79 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 216 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  35.09 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  40.23 
 
 		 223 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  40.3 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  36.99 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  33.33 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 256 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  35.11 
 
 		 545 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 216 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  35.44 
 
 		 194 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  37.37 
 
 		 198 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  42.42 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  38.81 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  40.58 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  38.57 
 
 		 208 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  39.44 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  38.57 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  38.57 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  31.25 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  40 
 
 		 265 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  40 
 
 		 265 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  37.04 
 
 		 195 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  40 
 
 		 215 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  40 
 
 		 206 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  40 
 
 		 206 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 292 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  40 
 
 		 206 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 222 aa  50.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  31.53 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  31.31 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  40 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  38.24 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.81 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  40 
 
 		 265 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  32.63 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  35.82 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  37.31 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  39.39 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 379 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  40.3 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 267 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  34.29 
 
 		 227 aa  48.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  38.24 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.19 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  35.96 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>