265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3771 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  51.92 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  48.62 
 
 		 110 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  56.58 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  46.6 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  49.35 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  45.33 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  48.1 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  46.99 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  47.95 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  34.65 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  38.96 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  40.91 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  38.75 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  32.04 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  37.5 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  33.01 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  30.61 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  36.71 
 
 		 235 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  37.84 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  35.21 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  30.97 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  30.97 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  30.97 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  36.76 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  36.76 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  40 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  37.88 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  36.76 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  36.76 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  40 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  30.97 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  32.5 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  36.62 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  31.07 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  35.79 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  31.88 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  31.07 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  31.07 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  31.07 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  31.88 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  39.39 
 
 		 261 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  39 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 236 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 267 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  37.88 
 
 		 257 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 229 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 229 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  39.71 
 
 		 318 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  31.18 
 
 		 237 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  39.13 
 
 		 203 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 254 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 227 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  37 
 
 		 208 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 254 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  31.52 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  34.52 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  32.03 
 
 		 284 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  32.47 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  37.37 
 
 		 235 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  33.33 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  35.64 
 
 		 243 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  31.94 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 221 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  34.31 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 230 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  38.46 
 
 		 239 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  27.88 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  39.39 
 
 		 230 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  33.8 
 
 		 382 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  34.33 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  34.85 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1072  cytochrome c553  39.02 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.538556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>