205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1844 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  100 
 
 		 116 aa  233  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  50 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  43.81 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  46.58 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  42.5 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  34.55 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  36.99 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  43.48 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  42.47 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  35.63 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  34.41 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  38.16 
 
 		 218 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  44.12 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  41.43 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  39.44 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 292 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  37.21 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  35.71 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  38.16 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  33.01 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  31.46 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  32.99 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  33.64 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  36.23 
 
 		 218 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 216 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  37.88 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  38.03 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  30.63 
 
 		 373 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  40 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  35.21 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  40 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3048  cytochrome c553  38.24 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.58659  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  33.33 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 225 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  33.77 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  44.12 
 
 		 228 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  33.78 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 218 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  42.03 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  31.76 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  34.04 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  34.33 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  29.52 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  34.21 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  33.33 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  33.75 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  33.75 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  33.75 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.85 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 212 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  34.33 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 262 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  32.1 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.82 
 
 		 202 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  29.49 
 
 		 269 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  32.73 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  31.65 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  35.29 
 
 		 240 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 382 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  34.58 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  32.1 
 
 		 262 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0987  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  33.85 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  28.4 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>