108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3048 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3048  cytochrome c553  100 
 
 		 99 aa  186  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.58659  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  77.63 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  41.98 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  40.66 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  43.28 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  42.67 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  39.71 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  34.69 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  39.51 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  38.27 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  36.62 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  42.47 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  38.54 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  31.68 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 216 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  35.21 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 256 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  32.38 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  37.78 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  27.47 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  40 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  30.69 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  38.57 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  34.48 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  30.69 
 
 		 243 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 237 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  37.78 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  40 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  29.82 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  29.82 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1799  cytochrome c family protein  36.67 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000599943  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  36.51 
 
 		 207 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  36.56 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  36.71 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 220 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 238 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 236 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 236 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 102 aa  43.5  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  36.23 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  29.33 
 
 		 228 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  28.71 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  34.92 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  34.92 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  42.19 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 242 aa  42  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  30 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  30 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  30 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  35.71 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  36 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0542  putative cytochrome c  37.04 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  36.96 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  30 
 
 		 253 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  30 
 
 		 253 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 192 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 124 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  34.38 
 
 		 149 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  30 
 
 		 234 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  30 
 
 		 253 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 103 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  34.15 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  30.61 
 
 		 257 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  36 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  29.85 
 
 		 253 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0987  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  30.25 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  33.67 
 
 		 208 aa  40.8  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  28.75 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  28 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1946  cytochrome c553  29.58 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.871766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  34.33 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  34.33 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>