109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1543 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  100 
 
 
102 aa  204  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  45.92 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  48.31 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  47.67 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  44.87 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  46.38 
 
 
179 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  43.48 
 
 
102 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1460  hypothetical protein  34.21 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  39.24 
 
 
217 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  34.72 
 
 
199 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  38.24 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  39.24 
 
 
216 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  36.78 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  33.77 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.47 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0398  cytochrome c family protein, putative  35.53 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  43.08 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  34.21 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  32.86 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  36.36 
 
 
209 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0196  putative cytochrome c family protein  32.89 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  37.97 
 
 
216 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  33.78 
 
 
203 aa  47.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  37.88 
 
 
103 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1164  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2802  cytochrome c, class I  32.05 
 
 
82 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1039  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.49098  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0768  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0274597  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  32.99 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  37.97 
 
 
216 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  35.82 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  35.56 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  40.51 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  30.43 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  33.33 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  34.85 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  35.62 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  32.47 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.71 
 
 
207 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  36.25 
 
 
237 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.71 
 
 
207 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.71 
 
 
207 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.71 
 
 
207 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  32.89 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  29.03 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  32.86 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  33.33 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1859  cytochrome c family protein  33.85 
 
 
324 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  30.77 
 
 
191 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  37.14 
 
 
207 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  37.14 
 
 
207 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  37.14 
 
 
207 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  34.48 
 
 
205 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  36.05 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  33.72 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  31.25 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  32.63 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  34.85 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  34.09 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  34.09 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  33.85 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  33.8 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  39.24 
 
 
217 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  33.85 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  33.85 
 
 
208 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  30.95 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  33.85 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  35.53 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  41.54 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  33.85 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  33.85 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  32.1 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  29.9 
 
 
206 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  32.58 
 
 
212 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  31.03 
 
 
124 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  33.77 
 
 
207 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  32.1 
 
 
104 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  35.06 
 
 
206 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  37.93 
 
 
100 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  35.87 
 
 
106 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  31.58 
 
 
194 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  33.82 
 
 
287 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  29 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  33.85 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  31.63 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  30.93 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  28.95 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  33.82 
 
 
273 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  30.56 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  37.66 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  28.72 
 
 
236 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  31.43 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  32.61 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  40 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  35.71 
 
 
219 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  32.86 
 
 
222 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  31.51 
 
 
223 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  31.33 
 
 
227 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  35.44 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  28.77 
 
 
229 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>