237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1330 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  100 
 
 		 106 aa  222  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  60.87 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  60.53 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  43.24 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  40.96 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  36.56 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  39.73 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  40 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  38.75 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  40.48 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  37.8 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  36.25 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  36.25 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  31.96 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  36.25 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  36.59 
 
 		 269 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 318 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  32 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  37.35 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  36.23 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  30.69 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  36.36 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  34.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  34.04 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  29.47 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  32.94 
 
 		 270 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  31.52 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  31 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  36 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  36.23 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  39.44 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 205 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  35.87 
 
 		 206 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 273 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  34.52 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  36.76 
 
 		 239 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  37.31 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  40 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  30.34 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  37.31 
 
 		 265 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  33.82 
 
 		 217 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 200 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  34.78 
 
 		 281 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  31.46 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  34.65 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  35.87 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  34.15 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  34.15 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  41.07 
 
 		 226 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 222 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  32.35 
 
 		 284 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  36.76 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  34.57 
 
 		 261 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  27.47 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  29.47 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 212 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 224 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  29.25 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  35.94 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  37.97 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  32.84 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  30.77 
 
 		 243 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  36.23 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0006  monoheme cytochrome c  28.12 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>