249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0685 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  100 
 
 		 116 aa  236  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  55.26 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  40.54 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  46.48 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  34.65 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  44.93 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  37.23 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  42.86 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  36.78 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  30.36 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  46.97 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  30 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  31.53 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  38.26 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  39.19 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  42.03 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  26.73 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  37.84 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  32.89 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  38.26 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  35.64 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  42.47 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  32.2 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  31.25 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  36.49 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  37.88 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  30.69 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39.71 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  42.67 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  44.78 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  31 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  28.04 
 
 		 256 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  30.23 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  28.3 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  29.51 
 
 		 253 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  29.51 
 
 		 253 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  29.51 
 
 		 253 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  33.33 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  29 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  30.43 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  30.43 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  30.43 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 225 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 236 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  29.51 
 
 		 253 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  28.32 
 
 		 202 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  25 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  28.42 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  32.43 
 
 		 206 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  25 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  25 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  31.31 
 
 		 234 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 236 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 239 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3048  cytochrome c553  39.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.58659  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  40 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  28.12 
 
 		 318 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  31.88 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  33.33 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 265 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 265 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  35.14 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  27.43 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  33.85 
 
 		 545 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  36.36 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  31.17 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0714  monoheme cytochrome c  29.29 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  31.68 
 
 		 238 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  29.85 
 
 		 225 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>