262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2428 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  100 
 
 		 110 aa  222  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  48.62 
 
 		 125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  53.61 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  61.84 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  43.93 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  48.35 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  43.18 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  49.33 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  51.35 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  46.34 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  44.12 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  44.93 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  42.47 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  39.42 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  43.66 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  46.38 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  39.77 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  38.61 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  39.08 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  33.64 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  41.98 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  37.11 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  38.57 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  37.97 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  37.97 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  37.23 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  37.33 
 
 		 318 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  43.84 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  36.76 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  45.07 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  32.71 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  36.26 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  41.79 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  39.76 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  41.79 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1176  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000869093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  31.48 
 
 		 239 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  34.78 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 237 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 265 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 206 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 206 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 265 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 206 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 205 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 267 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  33.33 
 
 		 207 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  30.7 
 
 		 222 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  36.76 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  41.54 
 
 		 545 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  37.5 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  35.82 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  40 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  44.9 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  36.96 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  35.29 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 238 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  35.9 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  30 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 265 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  35.53 
 
 		 260 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  37.88 
 
 		 228 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  35.53 
 
 		 234 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  34.18 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  29.52 
 
 		 382 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  33.68 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 208 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  29.59 
 
 		 200 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  33.82 
 
 		 208 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  34.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  33.82 
 
 		 208 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  37.14 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  28.3 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  37.5 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.97 
 
 		 210 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  35.87 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  33.67 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 226 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>