79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1724 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1724  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  309  1e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.751234  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  56.05 
 
 		 157 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  45.75 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1303  hypothetical protein  31.25 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00330826  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  36.36 
 
 		 432 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1725  hypothetical protein  31.94 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0935551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1302  hypothetical protein  29.89 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000762367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  41.1 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  40 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 223 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  39.06 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0444  hypothetical protein  30.56 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.48 
 
 		 318 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  36.07 
 
 		 222 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 242 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  41.67 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  37.31 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  40 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  44.26 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  44.26 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0670  hypothetical protein  26.39 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000296354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  38.71 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  27.12 
 
 		 269 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  24.76 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  27.4 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  31.65 
 
 		 237 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  42.62 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  32.81 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  24.79 
 
 		 266 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  32.81 
 
 		 255 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  36.23 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  24.76 
 
 		 212 aa  44.3  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  36.23 
 
 		 222 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  27.66 
 
 		 208 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 273 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  29.85 
 
 		 262 aa  43.9  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  27 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  27.16 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  32.86 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  32.86 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  39.34 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1963  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.77 
 
 		 299 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  36.07 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  34.29 
 
 		 213 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  35.71 
 
 		 102 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 256 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  29.85 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  29.85 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  25.58 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  30.3 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  29.85 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  26.67 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  34.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  27.59 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  24.46 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  35.09 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  37.88 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  30.14 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  42.62 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 208 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  30 
 
 		 217 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 107 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 208 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 208 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  32.31 
 
 		 106 aa  40.4  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>