13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0444 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0444  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1725  hypothetical protein  59.46 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0935551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0670  hypothetical protein  52.49 
 
 
180 aa  186  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000296354  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1302  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  111  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000762367  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  34.72 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1724  hypothetical protein  30.56 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.751234  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1303  hypothetical protein  28.92 
 
 
166 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00330826  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  35 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  27 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  30.34 
 
 
269 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  31.67 
 
 
221 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  23.53 
 
 
108 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  35.37 
 
 
266 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.148102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>