158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0669 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  317  5e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1724  hypothetical protein  56.05 
 
 
153 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.751234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  43.4 
 
 
149 aa  122  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1303  hypothetical protein  35.67 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00330826  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  35.48 
 
 
432 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  48.39 
 
 
209 aa  57.4  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  49.18 
 
 
205 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
249 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  41.79 
 
 
318 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1302  hypothetical protein  34.25 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000762367  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  38.24 
 
 
223 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  46.43 
 
 
225 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  45.16 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  39.47 
 
 
206 aa  52.4  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  41.38 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  40 
 
 
212 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  38.36 
 
 
109 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  40.3 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  46.43 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  36.78 
 
 
226 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  39.06 
 
 
242 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  40.35 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1725  hypothetical protein  29.58 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0935551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  47.54 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  39.13 
 
 
222 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  34.21 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  34.33 
 
 
110 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  39.13 
 
 
222 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  32.86 
 
 
192 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  26.9 
 
 
269 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  34.26 
 
 
104 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  46.43 
 
 
205 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  34.18 
 
 
237 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  37.68 
 
 
226 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  40.85 
 
 
107 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  35.82 
 
 
269 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  40.32 
 
 
198 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  40.98 
 
 
108 aa  48.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  31.88 
 
 
216 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  43.33 
 
 
196 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  43.33 
 
 
201 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  41.67 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  42.11 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  38.98 
 
 
103 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  35.82 
 
 
262 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0444  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  47.4  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  35.37 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  34.25 
 
 
238 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  40 
 
 
220 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  43.86 
 
 
219 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  43.66 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  35.94 
 
 
255 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  38.71 
 
 
198 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  34.25 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  28.36 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  37.14 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  33.8 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  41.94 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  24.84 
 
 
269 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.93 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  28.3 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  32.05 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  32.86 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  34.38 
 
 
200 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  38.33 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  40.26 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  38.1 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  40.32 
 
 
112 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  40.91 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  38.81 
 
 
217 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  39.34 
 
 
200 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  27.88 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  30.93 
 
 
195 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  41.67 
 
 
201 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  37.93 
 
 
217 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  37.5 
 
 
208 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  41.33 
 
 
287 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  39.39 
 
 
217 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  36.36 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  40.91 
 
 
208 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  35.53 
 
 
217 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  39.39 
 
 
217 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  27.88 
 
 
212 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  34.33 
 
 
262 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  32.31 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  40.32 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  34.33 
 
 
262 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  36.59 
 
 
209 aa  44.7  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  41.07 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  34.78 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  31.88 
 
 
212 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  40 
 
 
273 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  34.33 
 
 
262 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  39.51 
 
 
103 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.31 
 
 
210 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  38.71 
 
 
207 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  40.91 
 
 
208 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  40.91 
 
 
208 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  40.91 
 
 
208 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  32 
 
 
209 aa  43.9  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>