44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1302 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1302  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000762367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0670  hypothetical protein  38.83 
 
 
180 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000296354  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1725  hypothetical protein  37.24 
 
 
183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0935551  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0444  hypothetical protein  36.36 
 
 
182 aa  111  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1303  hypothetical protein  30.59 
 
 
166 aa  55.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00330826  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1724  hypothetical protein  29.89 
 
 
153 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.751234  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  34.25 
 
 
157 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  49.7  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  30 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  31.34 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  31.34 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  29.85 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  31.34 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  28.36 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  29.85 
 
 
254 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  29.85 
 
 
254 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  29.85 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  28.36 
 
 
253 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  28.36 
 
 
249 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  28.36 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  28.36 
 
 
253 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  28.36 
 
 
253 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  29.85 
 
 
236 aa  44.7  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  28.36 
 
 
249 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  28.36 
 
 
249 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.33 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  35 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  25.24 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  28.36 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  29.58 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  28.36 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  28.36 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  29.85 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  27.27 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  27.27 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  25.35 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  27.27 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  25.35 
 
 
545 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  25.35 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  25.35 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  31.43 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  25.3 
 
 
213 aa  41.2  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  25.3 
 
 
213 aa  41.2  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  28.36 
 
 
225 aa  41.2  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>