145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1303 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1303  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  338  2.9999999999999998e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00330826  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  35.67 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1724  hypothetical protein  31.25 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.751234  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  37.88 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  38.16 
 
 
205 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1302  hypothetical protein  30.59 
 
 
203 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000762367  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  34.67 
 
 
271 aa  54.3  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  39.73 
 
 
222 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  39.73 
 
 
222 aa  54.3  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  32.22 
 
 
242 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  34.12 
 
 
253 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  34.12 
 
 
253 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  30.77 
 
 
262 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1725  hypothetical protein  29.76 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0935551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  34.12 
 
 
249 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  34.12 
 
 
253 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  30.77 
 
 
262 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  34.12 
 
 
249 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  30.77 
 
 
262 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  34.12 
 
 
249 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
318 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0670  hypothetical protein  27.38 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000296354  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  34.29 
 
 
270 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  34.12 
 
 
234 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  33.78 
 
 
225 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  37.33 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  30.95 
 
 
223 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  37.33 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  36 
 
 
236 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  36 
 
 
236 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  35.71 
 
 
255 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  36 
 
 
254 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  36 
 
 
254 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  32.86 
 
 
212 aa  51.2  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  36 
 
 
236 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  30.77 
 
 
262 aa  50.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  39.06 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  35.62 
 
 
253 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  36.84 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  36.67 
 
 
206 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  38.36 
 
 
235 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  40 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  37.31 
 
 
226 aa  48.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
200 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  33.72 
 
 
212 aa  48.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  35.21 
 
 
212 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  32.81 
 
 
269 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  32.81 
 
 
269 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  34.78 
 
 
206 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  39.73 
 
 
201 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  39.73 
 
 
203 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0444  hypothetical protein  28.92 
 
 
182 aa  47  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  34.21 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  36.11 
 
 
284 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  39.73 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  34.33 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  40.24 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  34.29 
 
 
283 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  35.38 
 
 
228 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  36.92 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  38.36 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  37.5 
 
 
209 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  35.56 
 
 
211 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  32.93 
 
 
265 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  38.33 
 
 
98 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  32.18 
 
 
238 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  32.18 
 
 
238 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  30.77 
 
 
266 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  37.14 
 
 
219 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  32.18 
 
 
236 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  32.18 
 
 
236 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  28.72 
 
 
243 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  31.82 
 
 
209 aa  44.7  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  35.62 
 
 
103 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  30.67 
 
 
243 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  31.71 
 
 
217 aa  44.3  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  36.67 
 
 
257 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  36.99 
 
 
221 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  29.79 
 
 
209 aa  44.3  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  30.43 
 
 
222 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  32.93 
 
 
265 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  32.93 
 
 
265 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  34.25 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  34.38 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  32.93 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  33.85 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  35 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  33.8 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  33.33 
 
 
227 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  30.26 
 
 
108 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.9 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  33.33 
 
 
261 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.9 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  32.93 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  32.93 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  32.93 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  30.67 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.9 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>