47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0445 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  300  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  43.4 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1724  hypothetical protein  45.75 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.751234  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  43.84 
 
 		 432 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1303  hypothetical protein  31.71 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00330826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  39.06 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0444  hypothetical protein  34.72 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0935551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000762367  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  34.92 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0670  hypothetical protein  31.94 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000296354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  30.36 
 
 		 260 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  36.51 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  35.06 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  34.92 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  39.34 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  29.73 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  30.36 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  37.14 
 
 		 235 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.65 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  39.34 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  37.7 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  33.33 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  37.7 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  31.94 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  31.51 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  29.85 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 209 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  32.86 
 
 		 222 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  27.18 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  32.31 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  30.58 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  27.94 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  29.29 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  28.12 
 
 		 242 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  28.79 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  38.03 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  25.97 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.3 
 
 		 318 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  33.33 
 
 		 210 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>