85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1821 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  54.37 
 
 		 103 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  53.4 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  58.75 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  43.75 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  40.2 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  33.68 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  36.36 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  31.07 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  31 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  41.54 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  30.39 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  30.39 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0398  cytochrome c family protein, putative  34.83 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  29.41 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  30.69 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  33 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1303  hypothetical protein  35.62 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00330826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  35.19 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  29.41 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  29.13 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  34.29 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 382 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  34.91 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 255 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.67 
 
 		 318 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  32.86 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  25.93 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1709  putative cytochrome c family protein  34.12 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0233417  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  28.12 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 216 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  27.19 
 
 		 207 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  35.38 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 213 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  31.07 
 
 		 106 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  27.27 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 206 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 269 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 212 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  32.43 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  31.51 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4809  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  32.61 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  27.96 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  29.81 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  29.81 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  26.87 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  30.88 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  32.86 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1460  hypothetical protein  40.32 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  29.9 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  28.85 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  29.9 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  32.47 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  29.9 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2802  cytochrome c, class I  30.38 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190296  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  32.35 
 
 		 271 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  27.96 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  27.37 
 
 		 245 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  27.96 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>