16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0578 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  100 
 
 
94 aa  188  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  43 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  49.28 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  45.71 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  37.5 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  44.78 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  34.78 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  37.5 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  38.24 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  31.52 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  33.67 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0398  cytochrome c family protein, putative  40 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  38.36 
 
 
219 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  38.36 
 
 
219 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  29.59 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.71 
 
 
318 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>