More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1570 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  43.06 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  38.61 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  41.46 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  43.66 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  36 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  36 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  42.25 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  36 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  39.62 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  40.85 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  33.98 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  33.96 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  38.14 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  36.62 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  33.66 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  40 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  42.03 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  40 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  32.99 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  32.99 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.65 
 
 		 206 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  36.47 
 
 		 221 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  32.86 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  35.51 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  38.83 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  40 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  30.93 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  30.99 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  35.11 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  37.66 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  41.43 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  38.24 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  36.73 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  36.49 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  36.45 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  43.24 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  37.86 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  37.86 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  32.86 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  34.65 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  37.86 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  29.29 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.86 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  39.44 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  35.9 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  33 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  33.8 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  39.44 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.99 
 
 		 318 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  36.11 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 256 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  41.1 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  36.62 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  34.72 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  32.46 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  34.58 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  37.33 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 260 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  37.62 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 382 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  34.58 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>