33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1416 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  100 
 
 
104 aa  209  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  77.88 
 
 
104 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  62.92 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1602  cytochrome c553  62.65 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.330816  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  50 
 
 
101 aa  104  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  53.33 
 
 
100 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  49.04 
 
 
100 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  49.04 
 
 
100 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  48.08 
 
 
100 aa  98.2  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  50.48 
 
 
100 aa  94.4  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  40.95 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  36.05 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  29.52 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  29.52 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  29.52 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  34.02 
 
 
179 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  32.46 
 
 
238 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  37.08 
 
 
418 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  30.77 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  30.77 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  30.77 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  30.77 
 
 
119 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  29.87 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  30.77 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  30.77 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  29.49 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  29.49 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  29.49 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  29.49 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  29.49 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  29.49 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  29.49 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  30.77 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>