44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0474 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  100 
 
 		 101 aa  202  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  84 
 
 		 100 aa  175  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  84 
 
 		 100 aa  175  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  83 
 
 		 100 aa  174  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  50 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  51.92 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  54.46 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  52.48 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  51.65 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1602  cytochrome c553  40 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.330816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  33.66 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  33.66 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  37.62 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  37.08 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  40.24 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  37.27 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  30.85 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  31.68 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  31.52 
 
 		 248 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  34.41 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  28.44 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  27.37 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  35.53 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  35.53 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  36.49 
 
 		 122 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3829  cytochrome c, class I  34.69 
 
 		 99 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.284345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  36.49 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  36.49 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  36.49 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  34.34 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  36.49 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  36.49 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  36.49 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  30.39 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  31 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  36 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  30.85 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  24.77 
 
 		 216 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>