48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3829 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3829  cytochrome c, class I  100 
 
 		 99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.284345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  35.87 
 
 		 284 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  38.61 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  37.25 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.75 
 
 		 296 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  32.99 
 
 		 304 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 274 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  38.03 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  30.91 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 280 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.21 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.21 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.52 
 
 		 304 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 276 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 268 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  44.68 
 
 		 359 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.91 
 
 		 308 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  38 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 430 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.62 
 
 		 298 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.33 
 
 		 430 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  31.07 
 
 		 248 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.33 
 
 		 426 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.33 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  30.86 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  34.18 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  28.87 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  28.44 
 
 		 256 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  34.69 
 
 		 101 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  26.51 
 
 		 419 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  40.38 
 
 		 405 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  28.87 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  28.87 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  38.03 
 
 		 324 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  29.33 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  34.38 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  34.38 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  34.38 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003470  cytochrome c oxidase subunit CcoP  36.62 
 
 		 324 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.204703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  56.25 
 
 		 416 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  39.44 
 
 		 307 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1460  hypothetical protein  38.1 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.59 
 
 		 304 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.53 
 
 		 325 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>