122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0963 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  53.23 
 
 		 276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  57.92 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  51.39 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  52.55 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  50.98 
 
 		 284 aa  251  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  51.88 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  52.44 
 
 		 277 aa  241  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  54.05 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  50.61 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  51.63 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  50.2 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  50.59 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  50 
 
 		 295 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  47.37 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  50.38 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  51.15 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  48.29 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  50.41 
 
 		 289 aa  218  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  56.94 
 
 		 261 aa  218  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  48.78 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  50.43 
 
 		 262 aa  215  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  46.39 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  46.25 
 
 		 280 aa  208  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  54.17 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  48.4 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  51.13 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  37.21 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  45.28 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  42.45 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  48.44 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  48.43 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  48.43 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  48.43 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  46.61 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  49.53 
 
 		 295 aa  184  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  37.05 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.23 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  25.74 
 
 		 350 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.04 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  26.37 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.92 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  28.91 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.13 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.42 
 
 		 723 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.26 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  28.7 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.66 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  34.31 
 
 		 125 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  29.19 
 
 		 296 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.9 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  27.57 
 
 		 683 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  29.46 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0905  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  29.05 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.78 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  34.25 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  27.37 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  32.22 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3662  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.35 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.66 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1824  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.47 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.08 
 
 		 382 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.71 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1916  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  25.91 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  31.76 
 
 		 195 aa  45.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  31.52 
 
 		 636 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  35.87 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.81 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.56 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.9 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.47 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.12 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 647 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  34.09 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 647 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  26.51 
 
 		 513 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0377  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.51 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  37.35 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  27.81 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  29.68 
 
 		 435 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.34 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1956  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.26 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  26.63 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4809  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  23.3 
 
 		 718 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  29.38 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.67 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3062  hypothetical protein  34.88 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  29.95 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  29.92 
 
 		 432 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  26.89 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3829  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 99 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.284345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.95 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1794  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.35 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.448855  normal  0.0580758 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  27.6 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  27.08 
 
 		 355 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.87 
 
 		 637 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>