192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0180 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  100 
 
 		 636 aa  1267    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  77.34 
 
 		 632 aa  974    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  77.96 
 
 		 632 aa  932    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  78.74 
 
 		 631 aa  994    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  68.94 
 
 		 633 aa  872    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  95.6 
 
 		 647 aa  1197    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  70.02 
 
 		 629 aa  816    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  96.54 
 
 		 647 aa  1210    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  68.62 
 
 		 652 aa  836    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  42.02 
 
 		 645 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  38.8 
 
 		 653 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  41.53 
 
 		 657 aa  379  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  38.9 
 
 		 652 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  38.68 
 
 		 653 aa  350  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  37.67 
 
 		 664 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.9 
 
 		 637 aa  347  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  37.66 
 
 		 642 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  37.66 
 
 		 642 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  40.07 
 
 		 647 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  37.83 
 
 		 640 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  36.79 
 
 		 642 aa  340  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  37.83 
 
 		 640 aa  339  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  33.54 
 
 		 683 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  36.36 
 
 		 643 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  34.1 
 
 		 652 aa  324  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  35.3 
 
 		 644 aa  320  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  36.56 
 
 		 649 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  35.06 
 
 		 413 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  34.64 
 
 		 572 aa  162  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  35.89 
 
 		 634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  38.01 
 
 		 254 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  32.26 
 
 		 396 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  29.28 
 
 		 646 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  27.27 
 
 		 679 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  29.01 
 
 		 647 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  30.66 
 
 		 639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  30.66 
 
 		 639 aa  134  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  30.66 
 
 		 639 aa  134  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  32.1 
 
 		 634 aa  134  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.16 
 
 		 603 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  27.42 
 
 		 637 aa  126  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  30.33 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  34.35 
 
 		 660 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.87 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  32.74 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  28.08 
 
 		 696 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  30.26 
 
 		 691 aa  101  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  29.22 
 
 		 696 aa  101  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  28.08 
 
 		 696 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  29.63 
 
 		 743 aa  99  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  29.33 
 
 		 782 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  26.42 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  26.42 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  28.04 
 
 		 846 aa  94.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  32.79 
 
 		 273 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  31.03 
 
 		 779 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  27 
 
 		 820 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  30.71 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 702 aa  70.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 702 aa  70.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  24.02 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  29.19 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  31.88 
 
 		 283 aa  70.5  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.96 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  29.81 
 
 		 579 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  31.07 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  30.13 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  35.1 
 
 		 281 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  30.88 
 
 		 287 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  30.51 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  28.09 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  27.65 
 
 		 325 aa  63.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  31.58 
 
 		 284 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  31.45 
 
 		 329 aa  62  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  36.59 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  28.29 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  29.32 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  31.8 
 
 		 281 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  30.22 
 
 		 571 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  29.79 
 
 		 278 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  31.51 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  29.73 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  32.08 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  24.23 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  37.61 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  33.02 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  31.78 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  31.28 
 
 		 691 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  27.39 
 
 		 290 aa  57  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  28.91 
 
 		 279 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  28.91 
 
 		 276 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  28.91 
 
 		 276 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  28.91 
 
 		 276 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  28.3 
 
 		 281 aa  56.2  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  28.91 
 
 		 276 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  28.91 
 
 		 276 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  28.91 
 
 		 276 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  30 
 
 		 284 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>