74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3341 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  100 
 
 		 295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  57.62 
 
 		 277 aa  288  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  56.55 
 
 		 270 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  59.59 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  56.65 
 
 		 275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  50.8 
 
 		 280 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  54.07 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  60.27 
 
 		 255 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  52.8 
 
 		 272 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  51.2 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  52.8 
 
 		 272 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  52.8 
 
 		 272 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  49.03 
 
 		 271 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  49.03 
 
 		 276 aa  245  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  50.19 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  50.54 
 
 		 295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  49.43 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  46.53 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  47.08 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  47.47 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  47.95 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  47.95 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  47.33 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 289 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  45.91 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  47.11 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  47.42 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  45.23 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  44.26 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  46.22 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  47.47 
 
 		 259 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  43.8 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  36.36 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  49.76 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  37.21 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  35.21 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.79 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.67 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  26.16 
 
 		 350 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  35.71 
 
 		 125 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2096  cytochrome c oxidase cbb3-type subunit III  31.62 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0537  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.19 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.931468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 164 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  35.9 
 
 		 720 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.94 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.25 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  35.71 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2070  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.23 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.13 
 
 		 723 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  29.66 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  25.95 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 421 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  33.72 
 
 		 151 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.66 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  29.75 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  27.06 
 
 		 212 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.76 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.75 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  38.81 
 
 		 120 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.27 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.93 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.93 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  23.47 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 101 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0341  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  26.56 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0261936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  25.14 
 
 		 537 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  25.14 
 
 		 537 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.56 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  27.55 
 
 		 208 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  32.91 
 
 		 113 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.88 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.56 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  32.91 
 
 		 113 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>