More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0557 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  100 
 
 		 683 aa  1380    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  34.91 
 
 		 314 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 296 aa  112  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  33.95 
 
 		 254 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  34.11 
 
 		 687 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  37.27 
 
 		 1187 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.2 
 
 		 1187 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 444 aa  92  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  43.36 
 
 		 1187 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  40.98 
 
 		 806 aa  88.6  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  40.98 
 
 		 806 aa  88.6  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.02 
 
 		 429 aa  87.8  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2859  hypothetical protein  29.08 
 
 		 307 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  46 
 
 		 432 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40 
 
 		 1187 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  42.2 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.98 
 
 		 831 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  35.33 
 
 		 1202 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  40.65 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  40.65 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.5 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.29 
 
 		 680 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.64 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.64 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  36.23 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  40.8 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  41.96 
 
 		 1181 aa  84  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  40.8 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  40.8 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  40.8 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  40.8 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  40.8 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  40.8 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  36.03 
 
 		 428 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.03 
 
 		 428 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  36.03 
 
 		 428 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  40.68 
 
 		 467 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  34.81 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  44.55 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  34.44 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.58 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  32.12 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.52 
 
 		 726 aa  82.4  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.66 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  39.32 
 
 		 975 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  36.72 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.44 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  40.18 
 
 		 976 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.16 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.56 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.01 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  42.73 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  39.6 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  43.4 
 
 		 675 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0648  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.02 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  39.02 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  39.02 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.18 
 
 		 1179 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.57 
 
 		 429 aa  80.1  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 466 aa  80.1  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  38.79 
 
 		 432 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  37.93 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  38.39 
 
 		 420 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.86 
 
 		 1207 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  37.93 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.74 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.82 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  40.37 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.82 
 
 		 1191 aa  79.7  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2479  cytochrome c family protein  36.11 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  42.57 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  39.67 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.57 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  37.82 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  42.57 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0728  cytochrome c-related protein  30.39 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  36.7 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  40 
 
 		 1215 aa  78.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  37.07 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.07 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.22 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  38.02 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.07 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.39 
 
 		 1253 aa  77.8  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.76 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  41.58 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  35.34 
 
 		 1183 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2867  cytochrome c-related protein  31.75 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>