148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2376 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  463  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  30.33 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  29.22 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  26.37 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 123 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  25.73 
 
 		 418 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  28.07 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.79 
 
 		 298 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.18 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.61 
 
 		 426 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  22.38 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1529  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.5 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.9 
 
 		 723 aa  48.9  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4638  cytochrome c, class I  30 
 
 		 361 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  21.26 
 
 		 313 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3854  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.3 
 
 		 292 aa  48.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.81 
 
 		 326 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  22.86 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  32.69 
 
 		 101 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  32.58 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0700  hypothetical protein  28.24 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00453627  normal  0.367447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  28.09 
 
 		 439 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  23.68 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  21.05 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  20.57 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.56 
 
 		 325 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  21.53 
 
 		 327 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  30.85 
 
 		 683 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  23.98 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  22.06 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.11 
 
 		 308 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  22.58 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.04 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.04 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  22.06 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.08 
 
 		 313 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  21.83 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  26.83 
 
 		 314 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  30.61 
 
 		 143 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  30.61 
 
 		 143 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  21.26 
 
 		 325 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  32.61 
 
 		 642 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  32.29 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  32.61 
 
 		 642 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3662  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.74 
 
 		 294 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  29.03 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  24.67 
 
 		 429 aa  45.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003470  cytochrome c oxidase subunit CcoP  21.95 
 
 		 324 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.204703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  30.39 
 
 		 151 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  21.78 
 
 		 324 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  31.52 
 
 		 642 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  31.52 
 
 		 640 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0693  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoP subunit  21.43 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 470 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  23.12 
 
 		 437 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 702 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 702 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5692  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.55 
 
 		 428 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  25.64 
 
 		 477 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.64 
 
 		 477 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2348  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  21.43 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.765339  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2585  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.79 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.93 
 
 		 461 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  21.97 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.98 
 
 		 447 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  28.43 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 419 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3330  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  23.3 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  20.69 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  28.87 
 
 		 468 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 475 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.08 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  26.97 
 
 		 439 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 475 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  28.44 
 
 		 629 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.27 
 
 		 475 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  28.12 
 
 		 775 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.56 
 
 		 447 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 452 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 497 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  29.75 
 
 		 382 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  28.72 
 
 		 631 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  26.57 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  24.84 
 
 		 773 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  34.83 
 
 		 425 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 452 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 452 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  34.48 
 
 		 452 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.88 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  34.48 
 
 		 452 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 452 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1877  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.44 
 
 		 325 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.020094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.87 
 
 		 461 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.64 
 
 		 469 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3756  cytochrome c, class I  28.41 
 
 		 428 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4612  cytochrome c, class I  28.41 
 
 		 428 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.59 
 
 		 429 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.32 
 
 		 434 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>