63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3134 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  100 
 
 		 311 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  61.98 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  42.58 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  41.99 
 
 		 276 aa  215  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  42.68 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  37.99 
 
 		 266 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  36.88 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  33.99 
 
 		 263 aa  176  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  38.43 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  36.45 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  35.18 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  37.45 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  36.33 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  34.56 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  36.6 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  36.39 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  35.15 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  35.1 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  36.33 
 
 		 278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  34.81 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  36.64 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  36.02 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  33.79 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  37.58 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  32.33 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  32.33 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  32.33 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  36.93 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  32.31 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  34.77 
 
 		 255 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  30.13 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  31.08 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  33.07 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.89 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.61 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  25.79 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4302  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.84 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0300725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.71 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.43 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.35 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.08 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1087  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.08 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  33.94 
 
 		 146 aa  45.8  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.51 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  26.99 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  31.11 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2821  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.51 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.35 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  26.62 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  30.99 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  29.29 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  24.22 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  24.69 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  26.02 
 
 		 151 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0184  cytochrome c, class I  30.1 
 
 		 220 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.85 
 
 		 474 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  26.15 
 
 		 175 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.9 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>