73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3558 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  100 
 
 		 273 aa  554  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  88.13 
 
 		 278 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  82.05 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  82.05 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  82.05 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  74.51 
 
 		 280 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  57.76 
 
 		 306 aa  315  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  59.78 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  59.42 
 
 		 275 aa  298  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  64.15 
 
 		 295 aa  288  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  51.2 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  50.57 
 
 		 277 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  57.02 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  48.61 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  49.41 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.7 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  48.16 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  54.38 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  46.72 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  45.25 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  47.51 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  46.03 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  45.8 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  45.15 
 
 		 289 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.78 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  44.62 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  47.03 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  44.08 
 
 		 277 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  46.59 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  45.66 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  43.32 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  46.28 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  50.23 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  43.44 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  34.46 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  36.79 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  29.29 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  29.9 
 
 		 718 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  24.86 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1916  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  26.73 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.29 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.06 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  38.03 
 
 		 701 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  35.06 
 
 		 125 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  32.79 
 
 		 718 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  29.29 
 
 		 230 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  39.19 
 
 		 678 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  31.29 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  30.11 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.56 
 
 		 720 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  29.66 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  31.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  28 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  29.66 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0084  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  22 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000832498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  29.35 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  31.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.01 
 
 		 723 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 164 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.67 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  22.84 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  29.47 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.67 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  33.96 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  32.93 
 
 		 709 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  32.91 
 
 		 137 aa  42.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 124 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0905  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  23.94 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  22.97 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  25.7 
 
 		 326 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  29.89 
 
 		 220 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  33.33 
 
 		 111 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>