53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3841 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  41.89 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  39.19 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  40 
 
 
97 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  34.72 
 
 
284 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  36.36 
 
 
100 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2405  cytochrome c class I  37.31 
 
 
100 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  33.75 
 
 
101 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  33.58 
 
 
146 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  34.18 
 
 
117 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  33.73 
 
 
428 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  33.73 
 
 
428 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.73 
 
 
428 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  32.58 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.94 
 
 
425 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  26.58 
 
 
101 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  27.78 
 
 
426 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2348  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.53 
 
 
290 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.765339  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  29.29 
 
 
273 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0693  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoP subunit  32.53 
 
 
290 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  31.43 
 
 
163 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3662  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.46 
 
 
294 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  32.5 
 
 
97 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  28.26 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  36.96 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.26 
 
 
293 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  30.3 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  30.3 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2440  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.76 
 
 
288 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0537  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.1 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.931468  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  34.18 
 
 
117 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  30.3 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.56 
 
 
311 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.06 
 
 
323 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  29.29 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  35.21 
 
 
98 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  33.71 
 
 
304 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.93 
 
 
426 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.71 
 
 
312 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.78 
 
 
382 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  29.29 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  32.58 
 
 
153 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  30.95 
 
 
424 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1152  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.36 
 
 
307 aa  42.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67748  normal  0.0615842 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.53 
 
 
433 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.26 
 
 
293 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  30.85 
 
 
110 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  28.72 
 
 
806 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0806  invasion gene expression up-regulator, SirB  30.1 
 
 
131 aa  41.6  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  28.72 
 
 
806 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  26.04 
 
 
270 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2564  hypothetical protein  32.32 
 
 
132 aa  41.6  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.44085  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.71 
 
 
296 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>