130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2780 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  100 
 
 		 164 aa  342  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6117  cytochrome c protein CopJ  44.44 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0965626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3236  hypothetical protein  43.04 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3596  hypothetical protein  54.72 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.705754 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  53.77 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3264  c-type cytochrome  53.77 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3786  cytochrome c class I  48.59 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117464  normal  0.511619 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4062  cytochrome c class I  48.59 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1741  cytochrome c, class I  46.21 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0189  putative cytochrome c class I  53.27 
 
 		 144 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2192  cytochrome c class I  48.65 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  40.43 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  40.43 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  43.52 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  38.53 
 
 		 196 aa  85.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  33.09 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0522  hypothetical protein  37.38 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  31.9 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0440  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00184102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1575  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2114  cytochrome c, class I  34.17 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 450 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.42 
 
 		 453 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  29.29 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.75 
 
 		 447 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.73 
 
 		 447 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.73 
 
 		 447 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2649  cytochrome c, class IC  32.67 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  32.29 
 
 		 286 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 429 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  31.13 
 
 		 419 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.07 
 
 		 454 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  32.29 
 
 		 391 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 214 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  28.7 
 
 		 420 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.36 
 
 		 418 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.63 
 
 		 420 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 469 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3948  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4418  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 394 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.16 
 
 		 419 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 393 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  31.37 
 
 		 394 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 393 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  31.37 
 
 		 394 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  34.35 
 
 		 388 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  34.35 
 
 		 388 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  30.17 
 
 		 439 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  31.25 
 
 		 286 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.34 
 
 		 434 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.17 
 
 		 441 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.97 
 
 		 420 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  36 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.58 
 
 		 440 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  33 
 
 		 437 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  30.84 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  28.97 
 
 		 429 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.21 
 
 		 447 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.38 
 
 		 530 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  28.12 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  32.11 
 
 		 430 aa  44.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  33.05 
 
 		 571 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.17 
 
 		 430 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.17 
 
 		 430 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  38.18 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  29.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1907  cytochrome c, class I  27.68 
 
 		 411 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  28.67 
 
 		 527 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  28.67 
 
 		 527 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  28.85 
 
 		 388 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.17 
 
 		 426 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.43 
 
 		 433 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 419 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  32.63 
 
 		 513 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  28.69 
 
 		 430 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  29.41 
 
 		 394 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  28.69 
 
 		 430 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  28.69 
 
 		 430 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.12 
 
 		 430 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28 
 
 		 403 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.85 
 
 		 531 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  25.21 
 
 		 430 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  27.55 
 
 		 415 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  32.77 
 
 		 520 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  30.7 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  27.55 
 
 		 415 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.68 
 
 		 439 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  26.43 
 
 		 560 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  32.04 
 
 		 438 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  28.69 
 
 		 434 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  32.73 
 
 		 294 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.41 
 
 		 448 aa  41.6  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  28.05 
 
 		 554 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 432 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.25 
 
 		 432 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.21 
 
 		 434 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>