79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1529 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  100 
 
 		 111 aa  229  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  70.79 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  70.79 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  56.48 
 
 		 111 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  56.25 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  48.65 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  50.5 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  47.75 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  44.14 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  56.98 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  44.55 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  42.34 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  42.34 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  45.05 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  45.36 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  44.23 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  44.21 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  46.53 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  42.34 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  44.35 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  51.72 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  47.42 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  44.19 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  45.45 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  44.55 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  40.66 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  37.07 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  31.82 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  34.51 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  34.41 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  38.75 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  28.85 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  31.65 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4492  cytochrome c, class I  27.5 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.7 
 
 		 298 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  29.79 
 
 		 284 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  28.87 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.07 
 
 		 294 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 285 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  27.78 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  29.25 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.58 
 
 		 723 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  30.14 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1933  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35 
 
 		 305 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0570892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  35.82 
 
 		 542 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 273 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 278 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0664  cytochrome c oxidase  28.89 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  34.41 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 163 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0161  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.39 
 
 		 307 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.822245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  32.93 
 
 		 381 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  33 
 
 		 307 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  29.03 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.32 
 
 		 305 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5245  cytochrome c class I  27.71 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.330524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  26.6 
 
 		 165 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  32.91 
 
 		 270 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  32.95 
 
 		 263 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  31.51 
 
 		 324 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  29.29 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 163 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0716  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.4 
 
 		 299 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000848569  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1566  diheme cytochrome c  39.74 
 
 		 324 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>