137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1200 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  100 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  72.07 
 
 		 111 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  62.73 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  59.46 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  61.26 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  53.15 
 
 		 111 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  55.86 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  55.86 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  48.65 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  54 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  53.41 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  56.32 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  45.69 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  45.54 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  46.08 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  44.79 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  44.79 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  42.99 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  42.73 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  38.39 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  41.84 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  36.52 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  40.95 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  28.7 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  30.28 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  36.59 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  32.14 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  31.62 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  32.32 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  36 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  35.16 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  40 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.33 
 
 		 311 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  40 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  36.71 
 
 		 290 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.05 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.59 
 
 		 293 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  34.62 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1152  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.1 
 
 		 307 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67748  normal  0.0615842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.5 
 
 		 293 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  32.46 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.5 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.41 
 
 		 292 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0466  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.56 
 
 		 287 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00151581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.71 
 
 		 293 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.04 
 
 		 298 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  30.56 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  30 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.1 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2440  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.71 
 
 		 288 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  38.27 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.56 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3416  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  34.62 
 
 		 325 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.64 
 
 		 312 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  32.56 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.62 
 
 		 310 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.9 
 
 		 293 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.9 
 
 		 293 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5018  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.29 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.16 
 
 		 296 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  30.84 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 313 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 		 726 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.73 
 
 		 747 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  30.84 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  30 
 
 		 647 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.55 
 
 		 296 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 289 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 289 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1529  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.44 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 111 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  41.03 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  28.04 
 
 		 647 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.12 
 
 		 294 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4959  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.29 
 
 		 287 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  28.04 
 
 		 636 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2575  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.62 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  37.33 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.05 
 
 		 313 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3662  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.41 
 
 		 294 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.65 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.49 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  36 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.59 
 
 		 349 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3779  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 306 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1087  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.65 
 
 		 304 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2997  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  36.11 
 
 		 307 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>