48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4489 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  100 
 
 
280 aa  557  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  83.45 
 
 
278 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  81.43 
 
 
278 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  82.73 
 
 
278 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  80.71 
 
 
278 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  80.71 
 
 
278 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  81.65 
 
 
277 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  62.09 
 
 
278 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  48.61 
 
 
266 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  49.4 
 
 
266 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  48.21 
 
 
266 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  47.41 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  45.32 
 
 
269 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  44.61 
 
 
273 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  44.27 
 
 
272 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  39.41 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  42.29 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  44.4 
 
 
268 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  36.76 
 
 
286 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  36.76 
 
 
286 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  37.01 
 
 
295 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  36.65 
 
 
290 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  32.74 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  22.73 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  22.38 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  42.7 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  32.71 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  31.55 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  31.37 
 
 
133 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  35.64 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  34.57 
 
 
117 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  28.48 
 
 
176 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  38.82 
 
 
98 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  29.75 
 
 
132 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  32.56 
 
 
117 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 
344 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  31.31 
 
 
427 aa  45.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  28.05 
 
 
145 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  27.38 
 
 
209 aa  45.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  32.53 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  34.65 
 
 
355 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  28.68 
 
 
370 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  36.05 
 
 
104 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  27.38 
 
 
446 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.88 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  33.96 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  23.08 
 
 
149 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  33.71 
 
 
283 aa  42  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.93712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>