53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1587 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  606  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  96.56 
 
 		 291 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  24.04 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  24.3 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  22.38 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  22.38 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  24.42 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  22.38 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  24.27 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  25.6 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  21.12 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  22.73 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  22.01 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  23.26 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  22.57 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  24.88 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  24.73 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  26.47 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  24.14 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  40.32 
 
 		 107 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  40.32 
 
 		 107 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  35.8 
 
 		 112 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  25.11 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  38.33 
 
 		 107 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  38.33 
 
 		 107 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  28.72 
 
 		 720 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  29.47 
 
 		 101 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  21.72 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5417  cytochrome c-551  36.51 
 
 		 107 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5035  cytochrome c-551  36.51 
 
 		 107 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4865  cytochrome c-551  36.51 
 
 		 107 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5273  cytochrome c-551  36.51 
 
 		 107 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4880  cytochrome c-551  36.51 
 
 		 107 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0850  hypothetical protein  31.82 
 
 		 119 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  26.25 
 
 		 769 aa  45.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  34.92 
 
 		 107 aa  45.8  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  32.32 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.17 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  29.07 
 
 		 97 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 98 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  24.62 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1596  hypothetical protein  29.55 
 
 		 136 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  26.26 
 
 		 120 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.33 
 
 		 747 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0034  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551832  normal  0.0979537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 97 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 97 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  36.62 
 
 		 556 aa  42.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 97 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>